From e000248e5b97eeb025ac508341981eca15f45064 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: chn Date: Sun, 14 Apr 2024 16:26:14 +0800 Subject: [PATCH] add note --- devices/xmupc1/README.md | 13 +++++++++---- 1 file changed, 9 insertions(+), 4 deletions(-) diff --git a/devices/xmupc1/README.md b/devices/xmupc1/README.md index b172ee85..9e43c229 100644 --- a/devices/xmupc1/README.md +++ b/devices/xmupc1/README.md @@ -186,22 +186,21 @@ samba 就是 windows 共享文件夹的那个协议。 VASP 有很多很多个版本，具体来说： -* VASP 多个版本可以共存。目前安装了两个版本：6.3.1 和 6.4.0。 -* VASP 可以用不同的编译器编译。目前安装的有：nvidia、gnu、intel 和 amd。nvidia 使用 GPU 计算，其它的只能用 CPU 计算。 +* VASP 多个版本可以共存，但为了简单只安装了 6.4.0 版本。 +* VASP 可以用不同的编译器编译。目前安装的有：nvidia、intel。nvidia 使用 GPU 计算，intel 能用 CPU 计算。其它版本性能不佳，没有安装。 * VASP 的 std/gam/ncl 版本有一点区别，一般用 std，只有一个 gamma 点的时候用 gam 会快一点，系统中存在方向不平行的磁矩时必须用 ncl。 * 无论哪个版本，都集成了下面这些补丁： * HDF5：用于生成 hdf5 格式的输出文件。 * wannier90：我也不知道干啥的，随手加上的。 * OPTCELL：如果存在一个 `OPTCELL` 文件，VASP 会据此决定弛豫时仅优化哪几个晶胞参数。 * MPI shared memory：用来减小内存占用。 + * VTST tools：用来计算 neb。 如何提交 VASP 到队列系统已经在上面介绍过了。下面的例子是，如果要直接运行一个任务的写法： ```bash vasp-nvidia-640-env mpirun -np 1 -x CUDA_DEVICE_ORDER=PCI_BUS_ID -x CUDA_VISIBLE_DEVICES=0 -x OMP_NUM_THREADS=4 vasp-std -vasp-gnu-640-env mpirun -np 2 -x OMP_NUM_THREADS=4 vasp-std vasp-intel-640-env mpirun -n 2 -genv OMP_NUM_THREADS=4 vasp-std -vasp-amd-640-env mpirun -np 2 -x OMP_NUM_THREADS=4 vasp-std ``` 其中 `CUDA_VISIBLE_DEVICES` 用于指定用哪几个显卡计算（多个显卡用逗号分隔）。 @@ -211,6 +210,12 @@ vasp-amd-640-env mpirun -np 2 -x OMP_NUM_THREADS=4 vasp-std 后面的 `mpirun xxx` 才是真的调用 VASP。 所以实际上你也可以在这个环境里做别的事情，例如执行上面的 `nvaccelinfo` 命令。 +要使用 VTST tools 里带的脚本，需要在命令前加上 `vtstscripts` 。例如： + +```bash +vtstscripts dist.pl POSCAR.init POSCAR.final +``` + ## mumax 问龚斌，我没用过。